Die Christoph Merian Stiftung unterscheidet in ihren Kerntätigkeiten strikt zwischen Förderung und Bewirtschaftung. Sie verwaltet ihr Renditevermögen von rund CHF 1,8 Mrd. selbst und legt dieses nach unternehmerischen Kriterien an. Aus historischen Gründen – die CMS zählt zu den grössten nichtstaatlichen Landeigentümerinnen der Schweiz – entfällt der Grossteil davon auf die Bewirtschaftung und Weiterentwicklung des Immobilienportfolios.